目前社會上存在着對性健康教育的種種誤解，影響青少年性教育的開展，有必要予以糾正。
誤解一：性教育導致過早發生性行為。專家認為，據來自世界各地的研究清楚地顯示，性教育不僅不會導致性行為過早發生，反而能導致推遲的、更負責任的性行為。
誤解二：性教育剝奪了兒童的“天真無邪”。專家認為，在幼年時獲得科學準確、與年齡相適應的、完整的正確信息，是所有兒童和青少年的權利。由於缺乏這些正確信息，兒童和青少年會從他們的同伴、媒體或其他信息來源得到相互矛盾、有時甚至是錯誤的信息。而優質的性教育通過提供正確信息和正確價值觀的培養使兒童及青少年免受錯誤信息的誤導。
誤解三：給青少年進行性教育是父母和廣大家庭的事情。專家認為，我們必須要承認父母在性教育中扮演的重要角色，並且家庭在性健康教育中也有着重要的作用。但僅僅有家庭的教育是不夠的，而政府的作用，就是通過教育部門、學校和老師，為優質的性教育提供適宜的學習環境、工具和材料。
誤解四：家長會反對學校開展性教育。專家表示，兒童和青少年在學校和教育機構度過大部分的時間，因此學校是他們學習性、艾滋病毒及性病傳播感染知識的非常恰當的環境。而且，對於大多數家長而言，教師是最合格、最值得信賴的信息提供者。
誤解五：性教育只適合年輕人而不適合年幼的兒童。專家表示，性教育包括了一系列的合作關係，不僅是性關係。要在兒童採取性行為之前，讓他們知道和認識這些關係。
因此從小就需要一些技能來了解他們的身體、關係及情感。性教育奠定了這個基礎——例如，學習身體各部位的正確名稱、瞭解人類生殖的原則、探索家庭和人際關係、學習例如安全和信任的概念。這些可以按照兒童的年齡增長逐步建立起來。
誤解六：教師們也許願意進行性教育，但是會感到不舒服、缺乏技能或害怕去做。專家表示，訓練有素和積極進取的教師是進行高質量性教育必不可少的一部分。明確學校政策及課程，是對在課堂中進行性教育的教師的最大支持。
誤解七：性教育已經包含在其他學科中(生物學、生活技能等)。專家表示，在許多地區，各部門、學校及教師已經在應對改善性教育所面臨的挑戰。
在承認他們所做努力的價值的同時，也要利用綱要所提供的機會，增強對課程和教學實踐的理解。
