從定義上基本能夠觀察出三者的不同，下面從三個方面具體闡述三者的區別。
1.形成的區別。
自來水是由天然水通過輸水管自流(或經一級泵房提水加壓)入水廠，在進入淨水構築物之前，投加混凝劑——硫酸鋁或聚合氯化鋁，加石灰提高原水鹼度和預加氯(視原水水質而定)後，進入網格反應池混凝形成礬花，流經蜂窩斜管沉澱池進行沉澱分離，再經過氣水反衝洗濾池進行過濾，進入清水池後加氯消毒，停留一定時間後經過二級泵房加壓輸送到供水管網，供生活飲用和生產使用。
純淨水是以符合生活飲用水衞生標準的水為原料，採用多種工藝，把水中的重金屬、三滷甲烷、有機物、放射性物質、微生物等有害、有毒、有異味物大部分去掉，消除對人體健康的直接和潛在危害，然後以桶裝的形式上市銷售，供給人們飲用。
礦泉水的形成是複雜的。它是由地下水流經了含有不同組分的巖層，經溶濾作用、陰陽離子交換吸附、生物地球化學等一系列物理、化學作用，使巖石中的微量和常量組分進入了地下水，富集到一定程度而形成各種不同類型的礦泉水。
2.成分的區別。
自來水是通過自來水公司處理過的供生活和生產的使用水，它含有二氯化合物等多種物質，還含有如Ca、Mg、Cl等離子及微量的細菌如大腸桿菌，另外還有一些其他的溶質。其中我國國家標準GB5749-85中規定：若只經過加氯消毒後供作生活飲用水的水源水，總大腸桿菌平均每升不得超過1000個，經過淨化處理及加氯消毒後供作生活飲用水的水源水，總大腸桿菌平均每升不得超過10000個。
純淨水是通過蒸餾、反滲透等技術來淨化原水的，而在去除有害物質的同時，也除去了幾乎所有對人體有益的微量元素和礦物質。它是不含任何雜質,無毒無菌,易被人體吸收的含氧活性水。
礦泉水和自來水、純淨水不同，它含有鋰、鍶、鋅、碘、硒等20多種微量元素和礦物質，有的還含有比較豐富的宏量元素，如富含Ga、Mg、K、Na等離子。
3.飲用方法的區別
自來水要煮開來喝。這樣可以殺滅其中的細菌，同時也可以將大多數揮發性的有機物(如三滷甲烷)在煮沸後除去。
純淨水是直接可以飲用的水，無所謂加熱或者煮沸，夏天一般涼飲，冬天加熱後飲用的多。
礦泉水一般不應加熱，可以稍微加温，最好不要煮沸。因為礦泉水含有鈣、鎂等宏量元素呈較多，有一定硬度，在常温下呈離子狀態，加温煮沸後鈣、鎂等離子易與碳酸根生成水垢析出，所以礦泉水最佳飲用方法是在常温下直接飲用。
