馬伊琍和文章離婚不到一年曝出新戀情，被拍到和神祕男性喝酒約會。該男子撫摸馬伊琍臉頰還上演了摸頭殺，馬伊琍握住男方的手十分親密。這位男子的身份馬上引起網友的熱議，目前馬伊琍方還沒有對此消息迴應。
馬伊琍離婚後重新陷入熱戀得到大家的祝福，此前她和高偉光拍戲的時候傳出緋聞。在朋友聚會上有是親密的舉動，不過後來她説兩人只是朋友關係。馬伊琍在出道後多出演獨立自強的女性，造型也多是簡潔幹練的女性。她曾説自己婚前大女人，婚後在家小女人。但是這段婚姻並沒有走下去。
2008年馬伊琍和文章結婚，生下兩個女兒。2014年卓偉週一見曝光文章出軌姚笛的新聞。文章承認外遇道歉，馬伊琍發微博表示且行且珍惜，馬伊琍父親發文表示原諒女婿。兩人的婚姻一直到2019年，兩人發文宣佈和平離婚。
在和文章在一起之前，馬伊琍和導演管虎有一段戀情。兩人在合作《黑洞》的時候相戀愛，又一起拍攝了《西施眼》，戀愛四年後分手。馬伊琍坦誠不後悔這段戀情，直言管虎的藝術造詣很高，不願意改變對方，結果都是自己選擇的。在拍攝奮鬥的時候和文章戀愛，兩人是姐弟戀，文章叫她馬司令。
近年來馬伊琍並沒有受到影響，在演藝事業上反而是蒸蒸日上。憑藉一部《我的前半生》獲得白玉蘭最佳女主角，飾演丈夫出軌離婚後重新找回自己人生的現代女性。2018年出演姚晨公司出品電影《找到你》，飾演一個痛失愛女的農村婦女，並且獲得中國電影導演協會女演員獎。2019年她合作劉燁的《在遠方》播出獲得好口碑。
